工作流

本页面包含所有微生物组分析工作流。

🔬 核心工作流

工作流	用途	难度
bioBakery	集成分析流程	⭐⭐ 中级

📊 bioBakery 工作流

完整分析流程:

1. 质量控制（fastp）
   ↓
2. 物种分类谱分析（MetaPhlAn）
   ↓
3. 功能谱分析（HUMAnN）
   ↓
4. 下游统计分析

特点:

• ✅ 集成多个 bioBakery 工具
• ✅ 支持宏基因组和宏转录组
• ✅ 完整的文档和教程
• ✅ Docker/Vagrant支持

安装:

# 使用 Docker
docker pull biobakery/biobakery

# 或单独安装工具
conda install -c bioconda metaphlan
pip install humann