CONCOCT

Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion

基本信息

属性	值
类别	binning
难度	⭐⭐⭐ 高级
语言	Python
GitHub Stars	137
标签	binning, MAG, unsupervised, gaussian-mixture

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/BinPro/CONCOCT
• 📄 论文: https://doi.org/10.1038/nmeth.2835

安装

pip install concoct

简介

Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://github.com/BinPro/CONCOCT
• 🎓 教程: https://concoct.readthedocs.io/en/latest/
• 📄 论文: Alneberg et al. (2014) Binning metagenomic contigs by coverage and composition. Nature Methods. DOI: 10.1038/nmeth.2835

相关工具

• MetaBAT 2
• MaxBin 2
• DAS Tool

相关概念

• Metagenome Assembled Genomes

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最后更新: 2026-03-30