Pharokka

快速噬菌体基因组注释工具，自动检测 tRNA、tmRNA 和基因功能

基本信息

属性	值
类别	viral-analysis
难度	⭐⭐ 中级
语言	N/A
GitHub Stars	0
标签	phage, annotation, fast, automated

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/gbouras13/pharokka
• 📄 论文: https://doi.org/10.1093/nargab/lqad054

安装

conda install -c bioconda pharokka

简介

快速噬菌体基因组注释工具，自动检测 tRNA、tmRNA 和基因功能

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://github.com/gbouras13/pharokka
• 🎓 教程: https://pharokka.readthedocs.io/en/latest/
• 📄 论文: Bouras et al. (2023) Pharokka: a fast scalable bacteriophage annotation tool. Bioinformatics. DOI: 10.1093/nargab/lqad054

相关工具

• VirSorter 2
• PHASTER
• CheckV

相关概念

• Genome Resolved Metagenomics

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最后更新: 2026-03-30