Flye

De novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

基本信息

属性	值
类别	assembly
难度	⭐⭐⭐ 高级
语言	C
GitHub Stars	910
标签	assembly, long-read, nanopore, pacbio, metagenomics

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/fenderglass/Flye
• 📄 论文: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0072-8

安装

conda install -c bioconda flye

简介

De novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://github.com/fenderglass/Flye/blob/flye/docs/USAGE.md
• 🎓 教程: https://github.com/fenderglass/Flye/blob/flye/docs/USAGE.md
• 📄 论文: Kolmogorov et al. (2019) Assembly of long, error-prone reads using repeat graphs. Nature Biotechnology. DOI: 10.1038/s41587-019-0072-8

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最后更新: 2026-03-30