Prokka

⚡ ♒ Rapid prokaryotic genome annotation

基本信息

属性	值
类别	genome-annotation
难度	⭐⭐ 中级
语言	Perl
GitHub Stars	964
标签	annotation, prokaryotic, gene-prediction, rapid, genome-annotation, functional-assignment, bacterial-genomes, gene-finding

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/tseemann/prokka
• 📄 论文: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu153

安装

conda install -c bioconda prokka

简介

⚡ ♒ Rapid prokaryotic genome annotation

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://github.com/tseemann/prokka
• 🎓 教程: https://github.com/tseemann/prokka#usage
• 📄 论文: Seemann (2014) Prokka: rapid prokaryotic genome annotation. Bioinformatics. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu153

相关工具

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• eggNOG-mapper
• DRAM

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最后更新: 2026-03-30