Salmon

超快速转录本定量工具，支持映射和无比对模式

基本信息

属性	值
类别	quantification
难度	⭐⭐ 中级
语言	N/A
GitHub Stars	0
标签	quantification, transcriptomics, metatranscriptomics, fast

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/COMBINE-lab/salmon
• 📄 论文: https://doi.org/10.1038/nmeth.4197

安装

conda install -c bioconda salmon

简介

超快速转录本定量工具，支持映射和无比对模式

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://salmon.readthedocs.io/en/latest/
• 🎓 教程: https://salmon.readthedocs.io/en/latest/salmon.html
• 📄 论文: Patro et al. (2017) Salmon provides fast and bias-aware quantification of transcript expression. Nature Methods. DOI: 10.1038/nmeth.4197

相关工具

• Kallisto
• STAR
• featureCounts

相关概念

• Metatranscriptomics

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最后更新: 2026-03-30