LEfSe

线性判别分析效应量工具，用于高维生物数据的类间差异分析

基本信息

属性	值
类别	downstream-analysis
难度	⭐⭐ 中级
语言	N/A
GitHub Stars	0
标签	biomarker, differential-abundance, LDA, biobakery

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/biobakery/LEfSe
• 📄 论文: https://doi.org/10.1186/gb-2011-12-6-r60

安装

conda install -c bioconda lefse

简介

线性判别分析效应量工具，用于高维生物数据的类间差异分析

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/
• 🎓 教程: https://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/
• 📄 论文: Segata et al. (2011) Metagenomic biomarker discovery and explanation. Genome Biology. DOI: 10.1186/gb-2011-12-6-r60

相关工具

• ANCOM-BC
• DESeq2
• phyloseq

相关概念

• Compositional Data Analysis

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最后更新: 2026-03-30