Pavian
交互式宏基因组分类结果可视化工具，支持 Kraken/KrakenUniq/Centrifuge 输出
基本信息
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 类别 | visualization |
| 难度 | ⭐ 初级 |
| 语言 | R |
| GitHub Stars | 446 |
| 标签 | visualization, interactive, classification, R |
链接
- 📦 代码仓库: https://github.com/fbreitwieser/pavian
- 🏠 主页: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz715
- 📄 论文: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz510
安装
bash
# R
BiocManager::install('Pavian')简介
交互式宏基因组分类结果可视化工具，支持 Kraken/KrakenUniq/Centrifuge 输出
使用示例
📝 更多使用示例请参考官方文档。
参考资源
- 📖 官方文档: https://github.com/fbreitwieser/pavian
- 🎓 教程: https://github.com/fbreitwieser/pavian/wiki
- 📄 论文: Breitwieser & Salzberg (2020) Pavian: interactive analysis of metagenomics data. Briefings in Bioinformatics. DOI: 10.1093/bib/bbz155
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最后更新: 2026-03-30