Clair3

长读长（ONT/PacBio）快速准确的 SNP/Indel 变异检测工具

基本信息

属性	值
类别	variant-calling
难度	⭐⭐⭐ 高级
语言	N/A
GitHub Stars	0
标签	variant-calling, long-read, SNP, Indel, nanopore

链接

• 📦 代码仓库: https://github.com/HKU-BAL/Clair3
• 📄 论文: https://doi.org/10.1038/s41587-021-01138-1

安装

conda install -c bioconda clair3

简介

长读长（ONT/PacBio）快速准确的 SNP/Indel 变异检测工具

使用示例

📝 更多使用示例请参考官方文档。

参考资源

• 📖 官方文档: https://github.com/HKU-BAL/Clair3
• 🎓 教程: https://github.com/HKU-BAL/Clair3#quick-demo
• 📄 论文: Zheng et al. (2022) Symphonizing pileup and full-alignment for deep and polymorphic nanopore variant calling. Nature Methods. DOI: 10.1038/s41587-021-01138-1

相关工具

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最后更新: 2026-03-30