Centrifuge
Classifier for metagenomic sequences
基本信息
| 属性 | 值 |
|---|---|
| 类别 | taxonomic-classification |
| 难度 | ⭐⭐ 中级 |
| 语言 | C++ |
| GitHub Stars | 271 |
| 标签 | taxonomic-classification, fm-index, memory-efficient |
链接
安装
bash
conda install -c bioconda centrifuge简介
Classifier for metagenomic sequences
使用示例
📝 更多使用示例请参考官方文档。
参考资源
- 📖 官方文档: https://github.com/DaehwanKimLab/centrifuge
- 🎓 教程: https://ccb.jhu.edu/software/centrifuge/manual.shtml
- 📄 论文: Kim et al. (2016) Centrifuge: rapid and sensitive classification of metagenomic sequences. Genome Research. DOI: 10.1101/gr.210641.116
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最后更新: 2026-03-30