bioBakery Workflow

Huttenhower 实验室开发的微生物群落分析工具集和教程平台，提供 MetaPhlAn、HUMAnN 等工具的集成环境

基本信息

• 输入格式: FASTQ (宏基因组或宏转录组)
• 输出格式: 物种丰度表、通路丰度表
• 难度: intermediate

使用工具

• MetaPhlAn
• HUMAnN
• fastp

步骤

1. 1. 质量控制（fastp）
2. 2. 物种分类谱分析（MetaPhlAn）
3. 3. 功能谱分析（HUMAnN）
4. 4. 下游统计分析

文档

https://huttenhower.sph.harvard.edu/biobakery